Гугли биокомпьютеринг.
возможные области - программирование биологических программ. я вот люблю vector nti и heroes_2.
интересное направление программирование обработчиков приема передачи сигналов из "мозга в комп."
для понимания био лучше читать школьные и вузовские учебники (можно онлайн)по хим. анатом. физиолог. и выше. А НЕ НАУЧПОП
интересное направление программирование обработчиков приема передачи сигналов из "мозга в комп."
для понимания био лучше читать школьные и вузовские учебники (можно онлайн)по хим. анатом. физиолог. и выше. А НЕ НАУЧПОП
Генный ассемблер, днк ассемблер
это ж скучно, не? ты будешь сидеть в своей лаборатории (допустим), и близко не увидишь никаких зверушек
Ну еба если ты любишь биологию и информатику то это очень даже занимательно, учавствовать в передовой области науки, иметь доступ к самым новейшим наработкам в этой области, дрочится с днк и знать природу существ на низшем уровне
днк это пиздец какой низкий уровень лал
При адекватном уровне абстракции да, ведь на базе теории струн ты не можешь делать вывод о предметах
а с морем нихуя связанного нет? исследования всякие, сбор статистики
Да, я охуел
Исследования есть, сбор статистики есть, программирования нет. Если опять же не уходить в гены. Захочешь рыбку или там медузу какую на гены разобрать, то добро пожаловать в .
Bioinformatics?
http://www.tinro-center.ru/home/aspirantura
Вот например, если с морскими тварями тянет жизнь связать. Но нужно специальность "биология" знать, да, хотя может на математическое моделирование и не надо.
Вот например, если с морскими тварями тянет жизнь связать. Но нужно специальность "биология" знать, да, хотя может на математическое моделирование и не надо.
Есть такая телега. То что сделано взаимодействием множества организмов, само является чем то вроде живности выполняющей накопление сохранение и передачу информации. Например город или коралловый риф.
Что ели как то проанализировать формы нагромождений полипов, (кому не нравятся рыбки, пусть будут муравьи) при помощи информационных методик, на предмет скрытого порядка или чего нибудь наподобие.
Что ели как то проанализировать формы нагромождений полипов, (кому не нравятся рыбки, пусть будут муравьи) при помощи информационных методик, на предмет скрытого порядка или чего нибудь наподобие.
забавно, спасибо
>то с биологией всё на уровне научно-популярных книжек и прочей лабуды
>Как слить две страсти вместе в едином оргазме?
Пойти учиться на биофак, и если за это время не заебет, то ближе к концу обучения на всяких ярмарках вакансий побазарить с представителями годных компаний на предмет наличия у них подобных вакансий. В принципе, к этому этапу можно приступить и без обучения на биофаке, но вероятность быть посланным нах будет побольше, потому что без знания матчасти ты кодомакака простая, каких полно. Чаще всего сложнее понять алгоритм, чем закодить его, тем более исследования - не бизнес, там код чаще всего выполняется один раз, а потому не страшно, если он будет говеный.
Тред не читал.
Угори по секвенированию геномов морских тварей.
И гугли bioinformatics for dummies.
пасиба
Системная биология в контексте экологии. Фактически - передовой рубеж биоинформатики (это я о системной биологии вообще). Почти наверняка уверен, что можно попасть в какую-либо морскую экологическую лабу, но для этого соответственно стоит разбираться в экологии. Ну и как выше заметили, системная молекулярка, структурка, ПО для биологов (стоит оче дохуя), разные омики.
на первый взгляд совсем не просто, у меня аж встал
почитал, прикольно
биокомпьютинг не биоинформатика http://www.ibch.ru/press/news/science/1008
http://www.ibch.ru/press/news/ys/1259
>Особенную нежность питаю к морским НЕХ
кстати, а ты знаешь что-нибудь про фауну возле черных курильщиков? Нас интересуют эти НЕХ.
-кун
ну, на уровне того, что эта хуйня живет не очень долго, но вокруг нее кучкуется самая жуткая поебень из глубин, и вообще, микроорганизмы, живущие там не привыкли полагаться на энергию солнца, им хватает того, что выбрасывают курильщики; что само по себе очень интересно
А ты где работаешь?
бамп
А я смотрю, этот некогда элитный раздел деградировал как и весь остальной харкач.
не был здесь года эдак 2
Ах, да, ОП, хоть ты и дурак, но у меня сегодня хорошее настроение, вот самое что тебя нужно, энтри левеловее придумать не могу http://rosalind.info/
не был здесь года эдак 2
Ах, да, ОП, хоть ты и дурак, но у меня сегодня хорошее настроение, вот самое что тебя нужно, энтри левеловее придумать не могу http://rosalind.info/
>не был здесь года эдак 2
Поди еще переводчика застал?
Нет, ты появился после моего ухода.
Такой- то ПРОРЫВ в ответ на нейтральный вопрос. Ты главное таблеточки- то свои не забывай принимать и все будет хорошо.
Лал, ты бабахнул от невинной шутки, а таблеточки принимать мне? Такой-то манямир у тебя в голове.
>ну че вы посоны, я же пошутил, ну не бейте
Ясно.
И в чем шутка?
Ебать, ты даун.
>ебать я обосрался со своей шуткой
Понятно.
бамп
Ай не пизди. R и Bioconductor бесплатный.
Еще и питон есть.
А еще можно самому сделать, тип нехуй буржуям платить))
ПО для биологического оборудования часто входит в стоимость самого оборудования. То же ПО для докинга стоит дохуя. Это как примеры, фришный софт я, понятное дело, в виду не имел.
хули секвенирование днк такое дорогое и хуйовое, биоинформатики дорогие
Дорогие реактивы+низкая продуктивность. За раз по Сенгеру можно прос еквенироватьмаксимум 600-800 пар нуклеотидов. А перед этим куски ДНК нужно еще и в плазмидах амплифицировать. А потом еще и всю ебалу, которую получили надо проанализировать. Так что цена на данный момент вполне оправдана. И этим не биоинформатики занимаются.
Я бы попытался попасть в НБИКС центр Курчатника. Правда, если ты животними не только интересуешься, но еще и любишь сильно, то не очень: облучать собак и резать крыс таким не нравится обычно. Можно и без гуро: отправлять белки на мкс, строить логические сети из живых нейронов, исследование мозга во все поля, но это уже без поямого контакта с животными.
>плазмидах амплифицировать
Вообще-то нет. Необходимость амплифицировать куски в плазмидах - это скорее исключение, нежели правило.
понятно.
я правильно понимаю, что днк - это эдакий код на языке, которого мы не знаем, причем жутко запутанный, ибо эволюция - нереальный индус?
днк это днк, никакого языка нет. язык у нас в голове.
образно выражаясь, ну епт.
Вообще там всё несколько сложнее. Собственно через числодробилку обычно что делают.
Во-первых, это собственно работа по секвенированию. Этот самый "код" неплохо бы еще прочитать, разные способы чтения дают по-разному упакованные результаты и разные типы ошибок, соответственно, ошибкм надо отсеять, куски - склеить. Для биоинформатика - работа самое то.
Во-вторых, всевозможные конструкции на поиск корреляций. Тут у тебя уже есть большая база относительно готовых последовательностей и данные о том, у кого они получены. Твоя задача - найти, какие варианты с какими признаками связаны.
В-третьих, собственно анализ последовательности. Попытки предсказать, как та или иная конкретная последовательность себя в реальности поведёт, это как раз то, о чём ты говоришь, причём играть можно не только с последовательностью ДНК, но и с последовательностью белка.
В-четвёртых, всевозможные эволюционные конструкции - пытаться разобраться, как те или иные последовательности эволюционно связаны.
Ну, и есть ещё всякие относительно экзотические штуки, когда из массива последовательностей пытаются вытащить какие-то данные, которые очевидным образом из него не следуют. Моя любимая тема - это работа с повторами, которые традиционным секвенированием не отображаются (просто при сшивании непонятно, из какого повтора конкретный кусок), зато можно попытаться посмотреть на то, сколько раз данная последовательность была прочитана и из этого узнать, сколько раз на самом деле она в геноме повторяется, и это самый элементарный случай.
Это вот то, что я сходу вспомнил. Там относительно немного чистого "ДНК как код", просто потому, что там слишком много каких-то варинтов взаимодействия ДНК с белками (грубо говоря, слишком сложный и неочевидный компилятор), и такие штуки разбираются по отдельности в лабораториях, там скорее мощный и нетривиальный статистический анализ и data mining.
>код на языке, которого мы не знаем
Почему не знаем, уже больше полувека знаем. Другое дело, что над кодом стоят вещи куда более сложные.
>причем жутко запутанный
Самые общие принципы ясны (вроде бы), частные случаи часто вводят в ступор.
Как скажешь.
Знаем скорее не язык, а кодировку, если мы считаем нуклеотиды битами, а аминокислоты - собственно символами.
Трактовка термина сейчас не имеет значения, потому что всем и так понятно, что имеется в виду. Контекст, в котором находится данный код есть куда более важным, или как минимум, равнозначным фактором, нежели сам код.
Ну вот мне кажется несколько странным рассматривать "код ДНК" в общем смысле и контексте разговора, ограничиваясь только генетическим кодом и вообще кодирующей ДНК. Не, формально в плане терминов это, конечно, так, но если мы говори о "геноме как программе", то собственно алгоритмическая часть, очевидно, будет лежать как раз в регуляторных последовательностях. Впрочем, это спор о терминах и с посылом я, само собой, согласен.
Не хочу плодить треды, потому спрошу здесь, тема схожая.
А кто нибудь шарит в computational neuroscience? Понятно, что математики там занимаются построением искусственных нейронных сетей и алгоритмизацией, а вот биоинформатики туда нужны? И вообще есть ли какие то соприкосновения между нейробиологией и биоинформатикой, и какие там конкретно исследования ведутся, если ведутся?
А кто нибудь шарит в computational neuroscience? Понятно, что математики там занимаются построением искусственных нейронных сетей и алгоритмизацией, а вот биоинформатики туда нужны? И вообще есть ли какие то соприкосновения между нейробиологией и биоинформатикой, и какие там конкретно исследования ведутся, если ведутся?
БАМП
Алсо, покидайте туториалы по питону для биолуха плиз
Вот еще интересная тема:
https://ru.wikipedia.org/wiki/Биокомпьютер
https://ru.wikipedia.org/wiki/Биокомпьютер
пасиба, анон
>биология
>информатика
>картинка с рыбами всякими
http://postnauka.ru/video/3390 - там где-то в середине прогона про метагеном океана и отдельных океанских сообществ - this
альсо вот этот хуй дело базарит http://postnauka.ru/author/gelfand
Как слить две страсти вместе в едином оргазме? Особенную нежность питаю к морским НЕХ. Неужели нет таких профессий?