24 декабря Архивач восстановлен после серьёзной аварии. К сожалению, значительная часть сохранённых изображений и видео была потеряна. Подробности случившегося. Мы призываем всех неравнодушных помочь нам с восстановлением утраченного контента!

Вычисление протеинов

 Аноним OP 01/12/20 Втр 11:10:37 #1 №40827076     RRRAGE! 4 
proteins.gif
Мамкины трансгуманисты могут остужать свои пекарни занятые вычислением протеинов: гугловская нейроночка порешала проблему свертываемости белков показав 90 GDT (Global Distance Test), что сравнимо с экспериментальными методами.

Пруфы:
https://deepmind.com/blog/article/alphafold-a-solution-to-a-50-year-old-grand-challenge-in-biology
https://www.sciencemag.org/news/2020/11/game-has-changed-ai-triumphs-solving-protein-structures
https://www.nature.com/articles/d41586-020-03348-4
https://www.youtube.com/watch?v=gg7WjuFs8F4

We trained this system on publicly available data consisting of ~170,000 protein structures from the protein data bank together with large databases containing protein sequences of unknown structure. It uses approximately 128 TPUv3 cores (roughly equivalent to ~100-200 GPUs) run over a few weeks, which is a relatively modest amount of compute in the context of most large state-of-the-art models used in machine learning today.

All of the groups in this year’s competition improved, Moult says. But with AlphaFold, Lupas says, “The game has changed.” The organizers even worried DeepMind may have been cheating somehow. So Lupas set a special challenge: a membrane protein from a species of archaea, an ancient group of microbes. For 10 years, his research team tried every trick in the book to get an x-ray crystal structure of the protein. “We couldn’t solve it.”

But AlphaFold had no trouble. It returned a detailed image of a three-part protein with two long helical arms in the middle. The model enabled Lupas and his colleagues to make sense of their x-ray data; within half an hour, they had fit their experimental results to AlphaFold’s predicted structure. “It’s almost perfect,” Lupas says. “They could not possibly have cheated on this. I don’t know how they do it.”


Аноним OP 01/12/20 Втр 11:11:51 #2 №40827091     RRRAGE! 0 
EoFxMw1XMAEjhgK.jpeg
bump
Аноним ID: Подлый Крокодил Гена 01/12/20 Втр 11:12:31 #3 №40827098     RRRAGE! 1 
>>40827076 (OP)
И че? Можешь человеческим языком пояснить, в чем суть?
Аноним OP 01/12/20 Втр 11:15:44 #4 №40827141     RRRAGE! 0 
>>40827098
Нейроночку, которую до этого учили играть в шахматы, го и прочие старкрафты, научили решать задачу свертываемости белка достаточно точно, чтобы это было полезно в исследованиях всяких лекарств, биохимии и прочих ништяков.
Аноним OP 01/12/20 Втр 11:17:02 #5 №40827146     RRRAGE! 0 
EoFZcXzWMAMoqLJ.jpeg
bump
Аноним OP 01/12/20 Втр 11:20:14 #6 №40827182     RRRAGE! 0 
EoFG0tPXMAATlUr.jpeg
Bump.

Biology's ImageNet moment has arrived: #AlphaFold2 solves Protein Folding at the #CASP14 competition
Аноним ID: Воспитанный Ластик 01/12/20 Втр 11:22:58 #7 №40827215     RRRAGE! 0 
А потом нейросеточку распределят по васяновым комьюторам, и васяны опять в деле?
Аноним ID: Воспитанный Джокер 01/12/20 Втр 11:23:25 #8 №40827222     RRRAGE! 2 
>>40827141
Не совсем верно. Научили только решать задачу для известных и уже рассчитанных заранее белков. Неизвестные белки на которых её не тренировали она рассчитывать не может (в отличии от го, старкрафтов и подобный нейронок).
Аноним OP 01/12/20 Втр 11:24:01 #9 №40827231     RRRAGE! 5 
https://www.youtube.com/watch?v=KpedmJdrTpY

Последний бамп.
За сим закругляюсь, заморский барин ждет коммитов.
Аноним OP 01/12/20 Втр 11:25:52 #10 №40827251     RRRAGE! 0 
>>40827222
тебе ж сказали что breakthrough, а ты морду воротишь
Аноним ID: Мудрый Балда 01/12/20 Втр 11:26:21 #11 №40827259     RRRAGE! 1 
>>40827076 (OP)
Пиздеу ты тупой. Проблема не решена (и не будет).
Аноним ID: Ненасытный Дубс 01/12/20 Втр 11:30:38 #12 №40827304     RRRAGE! 0 
>>40827091
Аноним OP 01/12/20 Втр 12:00:00 #13 №40827623     RRRAGE! 0 
>>40827259
Безосновательный вскукарек.

Что мешает нагенерить трехмерных структур белков из рандомных одномерных цепочек аминокислот? Собрать базу, потом в ней искать подходящие кандидаты для нужных задач.
Приближенное решение для практики не хуже точного.
Аноним ID: Эпатажный Солдат 01/12/20 Втр 13:12:53 #14 №40828391     RRRAGE! 0 
15860251556151.jpg
>>40827141
>достаточно точно, чтобы это было полезно в исследованиях всяких лекарств
Нет. У них среднее отклонение 1.6 ангстрема, с частыми выходами на 4 А, а нужно хотя бы меньше 1А для нормального докинга. Я делал курсач по 2А, но в лабе все посмеивались над этой клоунадой включая меня самого.

И улучшить по существующей базе разрешение скорее всего нельзя, там слишком много говноструктур и слишком мало нормальных для тренировки.
Аноним ID: Эпатажный Солдат 01/12/20 Втр 13:15:47 #15 №40828421     RRRAGE! 1 
>>40827623
>Что мешает нагенерить трехмерных структур белков из рандомных одномерных цепочек аминокислот?
Охуевшая вычислительная сложность например, они вообще-то длинные.
>Приближенное решение для практики не хуже точного.
Ну охуеть вообще, расскажи это людям которые определяют структуры сайтов связывания.
Аноним ID: Щедрый Джельсомино 01/12/20 Втр 13:40:53 #16 №40828718     RRRAGE! 0 
>>40827076 (OP)
Вычисления протеинов уже не те. Всякие розетты и F@H майнят коронавирусную хуйню, и продают её как помощь ученым. И это при том, что крупные фармкомпании и так обладают несравнимо большими вычислительными ресурсами, тоже брошенными на корону.
Аноним ID: Гордый Гаврош 01/12/20 Втр 13:43:02 #17 №40828747     RRRAGE! 0 
Фейл с короной наглядно показал что это всё нифига не работает и по сути является банальными распилами.
Аноним ID: Темпераментная Димфна Фурмаг 01/12/20 Втр 18:13:35 #18 №40831883     RRRAGE! 0 
>>40827076 (OP)
Сейчас бы искуственному интеллекту доверять скручивать белки, он там такого накрутит, что все люди превратятся в подконтрольных машинам рабов. Это в любом случае неизбежно, но хотелось бы на своём веку ещё пожить по человечески, а не пойти в переработку на топливо для ИИ.
Аноним ID: Щедрая Русалочка 01/12/20 Втр 18:19:18 #19 №40831945     RRRAGE! 0 
Через сколько лет мы получим профит от этого?
Аноним OP 01/12/20 Втр 18:24:04 #20 №40832004     RRRAGE! 0 
>>40831945
Ну Google получит с этого профит точно, насчет нас трудно сказать
Аноним ID: Одаренный Пинхед 01/12/20 Втр 18:26:55 #21 №40832040     RRRAGE! 0 
>>40831883
Не усложняй, без электричества ИИ пизда.
Аноним ID: Игривый Джейсон Вурхиз 01/12/20 Втр 18:27:38 #22 №40832052     RRRAGE! 0 
>>40827623
>Что мешает нагенерить трехмерных структур белков из рандомных одномерных цепочек аминокислот? Собрать базу, потом в ней искать подходящие кандидаты для нужных задач.
А в чем смысл если ты и так можешь белки уже существующие смотреть? Только у них и задачи изучены, потому что они реальные, блять
>Приближенное решение для практики не хуже точного.
В биологии хуже
Аноним ID: Темпераментная Димфна Фурмаг 01/12/20 Втр 18:32:15 #23 №40832121     RRRAGE! 0 
>>40832040
Как только он научится белки крутить ему нахуй это электричество не нужно будет, он сможет энергию получать из любого пердежа.
Аноним OP 01/12/20 Втр 20:25:57 #24 №40833470     RRRAGE! 0 
>>40832052
>А в чем смысл если ты и так можешь белки уже существующие смотрет

Несуществующие смотреть. Если их в природе не существует не значит что их нельзя синтезировать.

>В биологии хуже

Там выше шарящий наверно анончик отписал, что их точности все же пока не достаточно для докинга. Но раз продемонстрировано, что способ рабочий, то будут копать дальше и улучшать.
Аноним ID: Стыдливый Песочный человек 01/12/20 Втр 20:47:39 #25 №40833792     RRRAGE! 0 
Круто. Слава роботам! И нейроночкам тоже слава.
Аноним ID: Озабоченный Премудрый пескарь 02/12/20 Срд 00:09:29 #26 №40835824     RRRAGE! 0 
>>40827076 (OP)
Готовьтесь к новой короне.
Аноним ID: Склочная Эльфрида Клегг 02/12/20 Срд 00:11:50 #27 №40835839     RRRAGE! 0 
>>40827076 (OP)
Пиздец, как я ненавижу эту борду. Я ровно сутки назад пытался это выложить и ебучая борда не дала мне, "Ошибка постинга IP" или чето такое там было. Пиздец блять.

Но ваще да, счетовод белков со своей капсулой соснул с проглотом as is.

А вообще, гайз, это огромный скачок вперёд. Невероятный скорее даже.
Аноним ID: Озабоченный Премудрый пескарь 02/12/20 Срд 00:13:56 #28 №40835853     RRRAGE! 1 
>>40835839
Ну да. Сделают всех сначала куколдами, потом пидорами, потом сатанистами, приносящих детей молоху и приправят чумой, чтобы не скучали. Люди-то в большинстве говно и явно наделают гадостей.
Аноним ID: Наглая Фрекен Бок 02/12/20 Срд 00:15:54 #29 №40835871     RRRAGE! 0 
59886379aP42-tbPBcLFRBUwbVHhQ5aj2w9UT9VIoTEhnYJL-g.jpg
>>40827076 (OP) Поясните за синтез белков, что это и зачем надо.
А то, например, про автопилотируемые машины было много крика, а закончилось невнятными оправданиями, что полноценного автопилота НЕ БУДЕТ.
Аноним ID: Вульгарный Супчик 02/12/20 Срд 00:15:58 #30 №40835872     RRRAGE! 0 
>>40835839
только человек больше не нужен...
Аноним ID: Безумный Адам Дженсен 02/12/20 Срд 00:18:56 #31 №40835893     RRRAGE! 0 
Кто-то может внятно пояснить нахуй их вычисляют и как это связано с поехавшими из вечных-бесконечных капсул-хуяпсул?
Аноним ID: Heaven 02/12/20 Срд 00:23:48 #32 №40835927     RRRAGE! 0 
>>40835871
Можно будет делать мясо из нефти. Буквально, в обход коров.
Аноним ID: Тоскливый Болотник 02/12/20 Срд 00:24:15 #33 №40835930     RRRAGE! 5 
>>40835872
А когда ты был нужен вообще? Куколд, порашник, инцел, бодовец, даже налогоплательщика произвести из влагалища неможешь. Зачем ты сейчас нужен и кому?
Аноним ID: Озабоченный Премудрый пескарь 02/12/20 Срд 00:25:23 #34 №40835938     RRRAGE! 0 
>>40835871
В итоге если хватит вычислительных мощностей для моделирования можно будет создавать какие угодно организмы. Кошкодевочку например. Или бактерию которая сделает тебя пидорасом.
Аноним OP 02/12/20 Срд 00:28:34 #35 №40835961     RRRAGE! 0 
>>40835893
Насчет капсул хз, видел только пару тредов, безобидный шиз.

>нахуй их вычисляют

Есть вероятность словить профиты в виде новых лекарств, полезных веществ и прочего прогресса, и все за счет анона.
Подробнее https://ru.m.wikipedia.org/wiki/Foldit
Аноним ID: Трепетный Солдат 02/12/20 Срд 00:35:47 #36 №40836008     RRRAGE! 1 
галактикаандромеда6324170.jpeg
>>40828747
Лично я думаю, что жиды придумали корону, чтобы искусственно подсадить всех гоев на куколдинг, заставив их сидеть дома, наказывать за попытки самостоятельно найти себе занятие и работу. При этом обратите внимание Роскомнадзор, который подчиняется главному жиду Шеломову, разбанил xhamster.com, где люди выкладывают всяческие извращения, как они дрочили в прошлом году на детских площадках, пляжах и рядом со старушками. Таким образом большинство населения путем воздействия порно и репрессиями против здравомыслящих и несогласных должно было натурально стать куколдами, если еще не надев втулку на член, то хотя бы привыкнув к демонстрации полового акта в извращенной форме рядом с ними и пассивной роли наблюдателя. Но китайский дракон, которому жиды отдали на аутсорсинг разработку коронавируса, он же кукодовирус, не соблюли чистоту в пробирках и техпроцесс, кроме того использовали не чистую человеческую генетику, из-за чего вирус вышел разбавленным, чуть тяжелее обычной пневмонии. Однако мировой Жидовоской Кагал все равно решил не отказываться от планов, и гойское стадо было все равно насильно загнано в стойла. А кто сопротивлялся - получил холодной водой на морозе или даже тюрьму, совсем как фашисты с русскими партизанами делали.
Аноним ID: Злобный Гоку 02/12/20 Срд 00:38:45 #37 №40836029     RRRAGE! 0 
>>40835927
Ага и на 1 грамм мяса надо будет потратить эквивалент 10 литров нефти
Аноним OP 02/12/20 Срд 00:40:11 #38 №40836037     RRRAGE! 0 
>>40836008
Неплохо ты поехавший конечно
Аноним ID: Озабоченный Премудрый пескарь 02/12/20 Срд 00:41:32 #39 №40836047     RRRAGE! 0 
>>40836029
Зачем. Сделаешь бактерию или несколько. Любой синтез тебе устроят.
Аноним ID: Веселый Брыкун 02/12/20 Срд 00:42:39 #40 №40836056     RRRAGE! 0 
>>40835938
>Или бактерию которая сделает тебя пидорасом
Ты что это предлагаешь сделать весь мир Русским?
Аноним ID: Склочный Доктор Шворц 02/12/20 Срд 00:53:56 #41 №40836127     RRRAGE! 0 
машк и генетика.jpg
>>40827076 (OP)
Всего 1 вопрос. Когда там кошка-девочки?
Аноним ID: Свирепый Мышиный король 02/12/20 Срд 00:58:30 #42 №40836147     RRRAGE! 0 
>>40836127
Кошкодевочкам права придется давать, и они будут жить только с другими кошкодевочками.
Аноним ID: Умный Шрек 02/12/20 Срд 01:01:23 #43 №40836161     RRRAGE! 0 
>>40836127
ОТПУСТИЛ КОШКОДЕВОЧКУ ПОГУЛЯТЬ
@
ЧЕРЕЗ 9 МЕСЯЦЕВ РОДИЛА 12 КОШКОНЕГРИТЯТ
Аноним OP 02/12/20 Срд 01:01:54 #44 №40836165     RRRAGE! 0 
>>40836127
Сразу после установки нейралинка
Аноним ID: Наглая Фрекен Бок 02/12/20 Срд 01:11:44 #45 №40836219     RRRAGE! 0 
S7B4fl.jpg
>>40836047 Ага, устроят они тебе кое-что другое.
Аноним ID: Наглая Фрекен Бок 02/12/20 Срд 01:13:11 #46 №40836223     RRRAGE! 0 
>>40835938 Программировать ДНК, создавать организмы можно?
Аноним ID: Сексуальный Линфред Стинчкомбский 02/12/20 Срд 01:13:29 #47 №40836225     RRRAGE! 0 
>>40836219
Какой же дебильный фильм, хосспаде.
Аноним ID: Озабоченный Премудрый пескарь 02/12/20 Срд 01:22:19 #48 №40836270     RRRAGE! 0 
>>40836223
Если моделировать научатся, думаю можно. Там же много что учесть надо, развитие организма на разных этапах, инстинкты. Пока что даже мозг электронный сделать не могут и посмотреть как он будет развиваться. Может на такое не хватит мощностей из-за ограничений физики в этом мире.
Аноним ID: Романтичный Веном 02/12/20 Срд 03:00:29 #49 №40836650     RRRAGE! 0 
>>40836225
ИЧСХ что из жокея и всратой кракатицы нихуя не ксеномроф получается, а хрен пойми какая хуита под названием Диакон. И будто фильм не достаточно дебильный, нужно было снять просто мозгодробилное продолжения, чтобы охуеть от отсутсвия любых границ дебильности.
comments powered by Disqus

Отзывы и предложения